Studium a badatelské zaměření protohistorické archeologie je na UHK orientováno na systematiku archeologických pramenů, archeologii Svébů a řešení témat z problematiky doby římské a doby stěhování národů se zaměřením na kontakty mezi barbary a římskou říší ve středoevropském prostoru, jakož i na vzájemné kontakty obyvatel rané doby dějinné Čech a Moravy. V rámci bakalářského a navazujícího magisterského studia získají absolventi archeologie Univerzity Hradec Králové nejucelenější přehled teoretických poznatků a praktických dovedností z časné doby dějinné a protohistorické archeologie v českém univerzitním prostředí.
Tři roviny pedagogického přístupu charakterizuje:
1) teoretický základ protohistorie a archeologie,
2) znalost archeologických pramenů včetně jejich interpretací,
3) praktické aplikace (psaní odborných textů, terénní výzkum a rekonstrukce).
Struktura výuky a výběr předmětů z oborů archeologie doby laténské, římské, stěhování národů a raného středověku a zvláště vyučující, kteří se vedle pedagogické činnosti věnují intenzivně vědeckému výzkumu (E. Droberjar, J. Musil, N. Profantová, J. Tejral, J. Waldhauser), jsou zárukou kvalitní přípravy mladých adeptů archeologie. Přímé propojení výuky, vědy a mezinárodní spolupráce směřuje k zapojení studentů do řešení projektů a do účasti na konferencích (protohistorické konference). V přípravě je výměna studentů mezi UHK a významnými univerzitními archeologickými pracovišti v Polsku a v Německu v oblasti teoretických a terénních výzkumů doby římské.